19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6359 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6359  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  341  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6357  hypothetical protein  53.71 
 
 
211 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6362  chromosome segregation ATPase  50.25 
 
 
483 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397181  normal  0.860165 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  49.32 
 
 
400 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0815  hypothetical protein  40.28 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5104  hypothetical protein  37.08 
 
 
673 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.711525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2041  chromosome segregation ATPases  41.29 
 
 
1176 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0464  gene 11-1 protein precursor, putative  41.04 
 
 
1301 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.45092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0458  PEST motif-containing protein  40 
 
 
939 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.028922  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6616  hypothetical protein  39.57 
 
 
439 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266008  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2047  chromosome segregation ATPases  44.71 
 
 
1199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0460  hypothetical protein  39.46 
 
 
1220 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.871611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2040  chromosome segregation ATPases  38.89 
 
 
754 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0814  hypothetical protein  40.44 
 
 
413 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449827  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6614  hypothetical protein  37.95 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5101  hypothetical protein  39.38 
 
 
547 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.517615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1945  chromosome segregation ATPases  38.73 
 
 
836 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5106  hypothetical protein  44.25 
 
 
181 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0532  chromosome segregation ATPase  39.87 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>