57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0158 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  98.3 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  79.22 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  60.44 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  52 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  58.82 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  47.83 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  46.43 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  49.34 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  40.89 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  44 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  35.71 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  35.81 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  36.8 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  36.02 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  37.44 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  34.51 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  35.5 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  35.06 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  35.53 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  31.22 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  33.63 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  33.19 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  33.19 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  30.57 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  30.57 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  31.42 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  27.88 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  29.2 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  30.41 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  27.16 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  27.71 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  27.71 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  25.33 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  26.91 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2567  WbqC-like family protein  25.54 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.873018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  28.12 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0823  hypothetical protein  21.1 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  23.45 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  23.35 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  23.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  20.43 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  26.05 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  26.24 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  25.11 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  26.55 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0702  WbqC-like family protein  27.57 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  24.11 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  26.39 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3843  hypothetical protein  21.79 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0372156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  20.85 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  20.8 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  26.88 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>