41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5018 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  41.75 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  38.92 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  38.92 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  33.98 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  35.18 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  34.17 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  30.77 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  30.37 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  26.94 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  27.31 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  28.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  27.31 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  25.46 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  27.93 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  26.24 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  30 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  22.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  24.66 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  24.22 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  27.85 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  26.29 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  25.11 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  24.66 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  22.32 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  22.97 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  26.91 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  28.41 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  21.86 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  23.42 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  26.43 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  21.88 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  22.28 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  24.45 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  26.03 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  23.79 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  23.63 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  25.57 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  21.36 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>