48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3184 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  38.53 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  39.37 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  37.28 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  37 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  37.02 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  35.37 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  33.78 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2567  WbqC-like family protein  35.22 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.873018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  29.69 
 
 		 233 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  32.91 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  31.2 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0823  hypothetical protein  34.82 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  31.56 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  30.73 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  28.19 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  26.13 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  26.13 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  26.72 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3843  hypothetical protein  27.84 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0372156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  30.04 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  23.35 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  24.88 
 
 		 273 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  26.38 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  27.8 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  26.18 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  22.27 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  25.78 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  27.23 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0702  WbqC-like family protein  25.63 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  25.33 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  28.83 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  24.78 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  24.11 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  22.83 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  25.86 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  25.69 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  25.88 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  22.94 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  22.71 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  21.86 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2174  Seryl-tRNA synthetase, class IIa-like protein  29.41 
 
 		 352 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  24.14 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>