33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1809 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  100 
 
 
207 aa  431  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  50.24 
 
 
206 aa  207  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  48.28 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  38.34 
 
 
203 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  38.12 
 
 
210 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  31.1 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  32.68 
 
 
217 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  31.71 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  30.77 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  34.5 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  34.5 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  25.7 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  28.63 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  23.89 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  23.73 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  25.43 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  25.76 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  24.14 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  22.84 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  19.61 
 
 
262 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  26.45 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  24.32 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  23.79 
 
 
246 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  21.15 
 
 
240 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  23.81 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  19.91 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  19.91 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  20.8 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  24.79 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  20.61 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  22.84 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  22 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  24.12 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>