52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1293 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  36.24 
 
 
231 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  37.34 
 
 
243 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  34.51 
 
 
229 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  35.24 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  35.11 
 
 
246 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  31.72 
 
 
227 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  32.73 
 
 
232 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  36.99 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  35.81 
 
 
232 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  33.62 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  32.62 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  31.22 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  31.22 
 
 
235 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  31.67 
 
 
240 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  31.7 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  32.74 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  30.26 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  31.51 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  32 
 
 
233 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  28.38 
 
 
232 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  32.29 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  32.24 
 
 
236 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  31.66 
 
 
273 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  31.73 
 
 
209 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  29.6 
 
 
232 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  26.72 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  26.03 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  26.03 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  30.32 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  27.71 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  27.71 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  27.75 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  28.51 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  27.85 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2567  WbqC-like family protein  25.57 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.873018  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0823  hypothetical protein  26.27 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  24.35 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  24.37 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  23.35 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  22.77 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  23.89 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  21.3 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  24.32 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  23.53 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  21.86 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  23.63 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  19.74 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>