36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2171 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  40.84 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  40.69 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  41.29 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  38.34 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  34.8 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  36.55 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  34.17 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  28.18 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  27.83 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  26.52 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  26.82 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  26.82 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  23.35 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  25 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  31.71 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  31.71 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  23.35 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  25.33 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  25 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  26.75 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  24.86 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  22.73 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  27.01 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  24.56 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  21.52 
 
 		 262 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  25.93 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  26.22 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  25.38 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  23.89 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  22.96 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  25.22 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  22.03 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  22.94 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  23.94 
 
 		 233 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>