49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5237 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  44.93 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  46.46 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  49.12 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  40.09 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  45.79 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  38.53 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  41.56 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  41.56 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2567  WbqC-like family protein  37.39 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.873018  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0823  hypothetical protein  34.11 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  36.15 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  30.74 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  32.13 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  29.82 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  33 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  31.08 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  30.41 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  30.41 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  29.06 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  27.63 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  30.14 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0702  WbqC-like family protein  35.71 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  28.77 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  29.36 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  29.36 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  25.57 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  28.76 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  26.52 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3843  hypothetical protein  30.21 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0372156 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  25 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  28.77 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  28.83 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  27.4 
 
 		 262 aa  85.1  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  24.89 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  24.75 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  28.57 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  27.98 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  29.44 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2174  Seryl-tRNA synthetase, class IIa-like protein  31.3 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  24.19 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  23.42 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>