33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2174 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2174  Seryl-tRNA synthetase, class IIa-like protein  100 
 
 
352 aa  714    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  33.87 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  27.48 
 
 
227 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  39.29 
 
 
262 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  37.5 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  36.36 
 
 
243 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  31.3 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  34.07 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  34.78 
 
 
236 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  28.26 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  34.07 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  34.07 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  34.38 
 
 
237 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3843  hypothetical protein  39.44 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0372156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  26.52 
 
 
232 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  27.17 
 
 
229 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  26.11 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  30.48 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  31.3 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  28.16 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  34.09 
 
 
224 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  32.18 
 
 
273 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  26.79 
 
 
230 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  27.47 
 
 
236 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
425 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  31.91 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  28.32 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  45.24 
 
 
240 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  23.85 
 
 
233 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  25.68 
 
 
209 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  31.58 
 
 
231 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.354473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>