46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3907 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  85.29 
 
 		 238 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  44.55 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3184  hypothetical protein  37 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2874  hypothetical protein  35.81 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0233  hypothetical protein  35.37 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2567  WbqC-like family protein  31.76 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.873018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  30.09 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  28.07 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3212  WbnG  32.46 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578652  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0823  hypothetical protein  30.22 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  32.44 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  28.96 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  29.17 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3843  hypothetical protein  31.96 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0372156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  29.17 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0702  WbqC-like family protein  31.34 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  28.31 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  22.91 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  24.2 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  24.35 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  25.56 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  24.22 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  26.89 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  23.73 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  25.74 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  21.3 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  23.42 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  23.94 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  23.98 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  23.98 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  26.05 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  21.89 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  26.43 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  23.14 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  23.32 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  22.79 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  26.01 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  23.42 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  39.86 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  24.67 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  22.82 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  26.16 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  23.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  28.07 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>