42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0463 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  96.23 
 
 
265 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  76.62 
 
 
159 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  74.21 
 
 
158 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  76.62 
 
 
159 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  74.21 
 
 
158 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  74.21 
 
 
158 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  74.21 
 
 
158 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  73.03 
 
 
180 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  73.86 
 
 
219 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  65.61 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  64.97 
 
 
184 aa  197  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  39.33 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  38.93 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  30.65 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  40.67 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3120  hypothetical protein  35.62 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2971  hypothetical protein  34.59 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675066  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  32.71 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  32.95 
 
 
105 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0175  hypothetical protein  31.25 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00679863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  32.08 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  27.93 
 
 
112 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  35.59 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  28.57 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  33.9 
 
 
99 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  30.65 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  31.25 
 
 
102 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  30.95 
 
 
99 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.328239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>