26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0743 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  56.7 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0718  hypothetical protein  38.04 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  43.01 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  38.54 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  40.91 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  39.6 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  37.63 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  40.68 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  42.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  40.68 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  42.37 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  40.32 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  38.98 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  35.59 
 
 		 265 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>