31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2746 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  202  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  56.7 
 
 
108 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0718  hypothetical protein  37.25 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  44.68 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  46.24 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  40.86 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  45.12 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  39.78 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  42.05 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  39.76 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  35.56 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  35.56 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  47.46 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  35.56 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  34.44 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  32.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  35.94 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  35.59 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>