14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0718 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0718  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  243  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  76.19 
 
 
105 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  66.32 
 
 
99 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  60 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  58.95 
 
 
99 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  57.58 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  57.89 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  53.33 
 
 
112 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  50.52 
 
 
102 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  38.04 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  27.38 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  31.75 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  31.75 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>