29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0826 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  204  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0718  hypothetical protein  76.19 
 
 
122 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  64.44 
 
 
99 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  63.83 
 
 
103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  61.11 
 
 
99 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  61.11 
 
 
99 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  60 
 
 
99 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  55.21 
 
 
102 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  56 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  44.68 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  31.75 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  31.75 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  27.71 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  31.75 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  28.74 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  28.74 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  28.74 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>