34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3462 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  97.52 
 
 
161 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  74.72 
 
 
180 aa  248  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  64.84 
 
 
219 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  62.43 
 
 
265 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  73.38 
 
 
158 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  68.15 
 
 
159 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  68.15 
 
 
159 aa  203  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  64.97 
 
 
159 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  37.91 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  37.25 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  40.13 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  28.36 
 
 
138 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2971  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3120  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432727  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  29.27 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  34.18 
 
 
99 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  34.18 
 
 
99 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  40.32 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  35.53 
 
 
99 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  33.87 
 
 
102 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>