28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2913 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  73.74 
 
 		 99 aa  153  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  70.71 
 
 		 99 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  70.71 
 
 		 99 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  70.41 
 
 		 99 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  64.29 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  63.83 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0718  hypothetical protein  57.58 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  45.12 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  42.37 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  38.24 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  38.24 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  34.52 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  33.77 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  35 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>