35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0494 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  97.52 
 
 
184 aa  309  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  79.04 
 
 
180 aa  248  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  68.79 
 
 
219 aa  207  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  68.15 
 
 
159 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  68.15 
 
 
159 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  73.38 
 
 
158 aa  203  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  67.3 
 
 
265 aa  203  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  65.61 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  38.56 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  40.4 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3120  hypothetical protein  34.84 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2971  hypothetical protein  34.42 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  27.61 
 
 
138 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  30.08 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  26.28 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0743  hypothetical protein  31.11 
 
 
108 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  31.65 
 
 
99 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  31.65 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  35.06 
 
 
99 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  33.87 
 
 
102 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  24.83 
 
 
150 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>