23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0130 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  28.69 
 
 
150 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  34.91 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  35.9 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  35.9 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  29.51 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  33.63 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  33.63 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  33.63 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>