24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3490 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  30.19 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  29.51 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  29.46 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  29.46 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3419  protein of unknown function DUF721  32.84 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  31.31 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  28.7 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  25.22 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  23.01 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  28.69 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  27.82 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>