53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3419 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3419  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
140 aa  275  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  32.54 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  35.9 
 
 
219 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  33.09 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  34.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  34.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  34.56 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  33.79 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  34.11 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  30.07 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  30.47 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  28.04 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  32.86 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  29.69 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  28.04 
 
 
140 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  28.24 
 
 
148 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  37.11 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  32.79 
 
 
209 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  32.79 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  32.79 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  32.88 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  30.09 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  30.09 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  32.88 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  30.09 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  30.95 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  32.2 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  31.67 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  31.94 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  30.14 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  32.84 
 
 
112 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  28.81 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0175  hypothetical protein  27.97 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00679863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  29.49 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  30.33 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  33.57 
 
 
173 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>