19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0189 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0175  hypothetical protein  68.1 
 
 		 165 aa  216  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00679863  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  32.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  32.23 
 
 		 265 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  26.28 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  31.73 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  30.09 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  31.73 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  26.8 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  30.48 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>