43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2911 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  346  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  346  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  346  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  79.31 
 
 
174 aa  278  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  67.82 
 
 
175 aa  234  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  66.67 
 
 
175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  60.12 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  61.54 
 
 
174 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  46.55 
 
 
173 aa  140  8e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  34.34 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  33.74 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  32.37 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  34.15 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  37.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  38.37 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  36.78 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  36.26 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  35.63 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  30.06 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  28 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  34.51 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  30.28 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0988  hypothetical protein  29.25 
 
 
102 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000290361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  34.85 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  30.82 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  35.66 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  35.66 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  35.16 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  34.94 
 
 
140 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  30.59 
 
 
100 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  34.94 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  31.76 
 
 
114 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  32.56 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>