39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004484 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  90.13 
 
 		 152 aa  286  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  52.32 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  41.03 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  32.35 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  32.94 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  33.13 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  33.74 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  33.74 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  33.74 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  30.88 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  31.85 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  28.91 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  27.07 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  28.29 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  26.22 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  29.23 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  29.23 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  28.91 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  27.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  27.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  27.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  27.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  27.82 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  28.67 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04360  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  28 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  28 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  23.01 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  24.73 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  24.73 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>