35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2971 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2971  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  329  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3120  hypothetical protein  75.6 
 
 		 167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  59.52 
 
 		 195 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  59.88 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  58.68 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  39.87 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  33.77 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  34.42 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  35.95 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  35.53 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  35.95 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  35.95 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  34.59 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  37 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  30.82 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4233  hypothetical protein  34.48 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  34.26 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0757  hypothetical protein  35.19 
 
 		 99 aa  44.3  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0794  hypothetical protein  35.19 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306391  normal  0.209598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5498  hypothetical protein  30.95 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.582245  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3930  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3691  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0826  hypothetical protein  30.12 
 
 		 105 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>