23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3843 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  100 
 
 		 319 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  78.06 
 
 		 319 aa  524  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  63.38 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  58.68 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  56.17 
 
 		 325 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  51.52 
 
 		 165 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  49.7 
 
 		 171 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  52.78 
 
 		 165 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  52.78 
 
 		 165 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  49.11 
 
 		 173 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  40.85 
 
 		 157 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  42.97 
 
 		 137 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  40.77 
 
 		 138 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  42.66 
 
 		 160 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  38.89 
 
 		 166 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  44.96 
 
 		 132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  44.96 
 
 		 132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  40.71 
 
 		 163 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  41.55 
 
 		 139 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  38.06 
 
 		 163 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  30.25 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  24.26 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>