17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0443 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  100 
 
 
149 aa  304  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  57.72 
 
 
149 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  39.72 
 
 
160 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  36.84 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  35.53 
 
 
163 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  33.56 
 
 
165 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  37.04 
 
 
165 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  37.04 
 
 
165 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  36.18 
 
 
163 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  29.17 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  29.86 
 
 
173 aa  84.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  31.51 
 
 
319 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  31.11 
 
 
325 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  30.25 
 
 
319 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  29.01 
 
 
319 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  26.25 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  28.77 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>