17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2834 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  100 
 
 
173 aa  358  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  78.03 
 
 
171 aa  276  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  58.14 
 
 
165 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  59.76 
 
 
325 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  56.44 
 
 
165 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  56.44 
 
 
165 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  47.06 
 
 
319 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  49.11 
 
 
319 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  45.24 
 
 
318 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  48.68 
 
 
160 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  51.43 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  42.51 
 
 
319 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  44.08 
 
 
163 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  38.82 
 
 
163 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  29.86 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  27.27 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  35.53 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>