17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1628 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  63.53 
 
 
171 aa  217  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  58.14 
 
 
173 aa  205  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  60.61 
 
 
165 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  60.61 
 
 
165 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  53.7 
 
 
325 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  51.52 
 
 
319 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  50.61 
 
 
319 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  50.31 
 
 
319 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  48.25 
 
 
166 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  44.03 
 
 
163 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  45.64 
 
 
318 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  43.84 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  39.35 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  33.56 
 
 
149 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  28.28 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  36.99 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>