17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1930 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  59.46 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  49.02 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  47.56 
 
 		 163 aa  153  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  47.3 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  47.3 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  48.68 
 
 		 173 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  43.84 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  44.3 
 
 		 325 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  38.82 
 
 		 319 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  42.66 
 
 		 319 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  39.72 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  39.29 
 
 		 319 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  36.18 
 
 		 318 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  32.87 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  36.54 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>