23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2542 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  100 
 
 		 325 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  56.17 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  55.56 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  50 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  50.78 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  60.48 
 
 		 171 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  59.76 
 
 		 173 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  53.7 
 
 		 165 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  56.94 
 
 		 165 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  56.94 
 
 		 165 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  46.1 
 
 		 166 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  44.3 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  42.03 
 
 		 137 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  42.48 
 
 		 163 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  44.93 
 
 		 157 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  40.88 
 
 		 139 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  40.3 
 
 		 132 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  40.3 
 
 		 132 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  38.96 
 
 		 163 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  37.69 
 
 		 138 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  31.11 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  33.56 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  25.93 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>