11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3554 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  53.97 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  54.84 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  52.71 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  45.31 
 
 		 319 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  44.96 
 
 		 319 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  43.31 
 
 		 318 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  40.3 
 
 		 325 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  41.27 
 
 		 319 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  43.9 
 
 		 138 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>