11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2720 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  56.91 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  53.97 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  53.97 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  51.2 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  48.46 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  42.03 
 
 		 325 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  42.97 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  39.57 
 
 		 319 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  40.62 
 
 		 318 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  38.89 
 
 		 319 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>