11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2231 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  100 
 
 
157 aa  322  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  62.1 
 
 
138 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  51.45 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  52.71 
 
 
132 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  52.71 
 
 
132 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  48.46 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  44.93 
 
 
325 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  40.85 
 
 
319 aa  120  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  41.06 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  40.65 
 
 
319 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  40.48 
 
 
318 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>