17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4810 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  57.41 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  59.46 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  55.62 
 
 
163 aa  180  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  51.43 
 
 
171 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  51.43 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  51.43 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  51.43 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  48.25 
 
 
165 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  46.1 
 
 
325 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  41.55 
 
 
319 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  38.89 
 
 
319 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  40.38 
 
 
319 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  36.84 
 
 
149 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  39.35 
 
 
318 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  34.87 
 
 
149 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  39.86 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>