17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4694 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  63.8 
 
 
163 aa  224  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  57.41 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  50 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  46.05 
 
 
171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  44.03 
 
 
165 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  42.96 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  42.96 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  44.08 
 
 
173 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  42.48 
 
 
325 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  39.74 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  40.14 
 
 
319 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  35.53 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  40.71 
 
 
319 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  36.42 
 
 
318 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  34.87 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  34.72 
 
 
176 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>