17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1426 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  100 
 
 		 149 aa  310  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  57.72 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  34.87 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  34.87 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  32.89 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  32.87 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  28.28 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  29.33 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  29.33 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  28.15 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  27.27 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  25.93 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  24.64 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  25.74 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  24.26 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  23.91 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  27.46 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>