17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3555 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  60.61 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  63.16 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  56.44 
 
 		 173 aa  187  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  56.94 
 
 		 325 aa  177  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  52.78 
 
 		 319 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  51.03 
 
 		 319 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  51.43 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  47.3 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  48 
 
 		 318 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  48.99 
 
 		 319 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  42.96 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  43.26 
 
 		 163 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  37.04 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  29.33 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  35.66 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>