17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2052 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  40.82 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  38.06 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  37.06 
 
 		 163 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  37.76 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  36.43 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  36.43 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  34.59 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  36.99 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  35.25 
 
 		 325 aa  95.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  35.86 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  29.45 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  28.28 
 
 		 319 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  30.34 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  30.22 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  28.87 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  25.34 
 
 		 318 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>