More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1387 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  90.79 
 
 
391 aa  708    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1387  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.52 
 
 
381 aa  604  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3629  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  78.01 
 
 
386 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3702  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.01 
 
 
386 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.98 
 
 
386 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.75 
 
 
386 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  77.4 
 
 
395 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.3 
 
 
382 aa  581  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  77.49 
 
 
394 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.06 
 
 
386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0445399  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  71.58 
 
 
383 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  69.25 
 
 
385 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.06 
 
 
385 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.54 
 
 
384 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.54 
 
 
384 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.61 
 
 
385 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  68.23 
 
 
385 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.77 
 
 
383 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  69.53 
 
 
384 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.79 
 
 
383 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.22 
 
 
383 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.15 
 
 
384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.75 
 
 
382 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.76 
 
 
388 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00480  butyryl-CoA dehydrogenase  61.26 
 
 
418 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.97 
 
 
384 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.86 
 
 
394 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  63.12 
 
 
388 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  57.87 
 
 
399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.08 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.0345333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  54.94 
 
 
394 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.08 
 
 
382 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.91 
 
 
379 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.35 
 
 
380 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.05 
 
 
380 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  48.7 
 
 
388 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.97 
 
 
381 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.97 
 
 
377 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  45.19 
 
 
381 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.94 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.43 
 
 
382 aa  329  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6425  butyryl-CoA dehydrogenase  43.95 
 
 
380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.17 
 
 
383 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.65 
 
 
383 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  43.98 
 
 
379 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  44.24 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  43.98 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.78 
 
 
380 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 
379 aa  322  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.6 
 
 
379 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  43.72 
 
 
379 aa  322  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.93 
 
 
382 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.42 
 
 
381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.46 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.49 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.26 
 
 
389 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.08 
 
 
380 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.16 
 
 
641 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 
379 aa  302  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.98 
 
 
380 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.26 
 
 
386 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  42.37 
 
 
379 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  42.37 
 
 
379 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.75 
 
 
377 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.75 
 
 
377 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.04 
 
 
380 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.32 
 
 
375 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  42.56 
 
 
379 aa  298  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.79 
 
 
375 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  42.74 
 
 
377 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 
402 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.47 
 
 
389 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.48 
 
 
377 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
375 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.42 
 
 
379 aa  295  6e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1141  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.56 
 
 
387 aa  295  9e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.63 
 
 
375 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  42.11 
 
 
378 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
379 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1647  butyryl-CoA dehydrogenase  43.6 
 
 
379 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.13 
 
 
379 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0439927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.95 
 
 
377 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.95 
 
 
377 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
379 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
380 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.95 
 
 
377 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>