More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1707 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  783    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.33 
 
 
380 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.81 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.11 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  54.64 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.97 
 
 
383 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  50.51 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.83 
 
 
384 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.31 
 
 
384 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00480  butyryl-CoA dehydrogenase  53.28 
 
 
418 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.02 
 
 
377 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  55.28 
 
 
385 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.5 
 
 
382 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.49 
 
 
384 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.59 
 
 
383 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.21 
 
 
383 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.59 
 
 
385 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 
381 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.56 
 
 
384 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.92 
 
 
382 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
381 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
381 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
381 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.07 
 
 
386 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0445399  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  50.66 
 
 
381 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  53.78 
 
 
385 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
399 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  54.59 
 
 
384 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3629  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.79 
 
 
386 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3702  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.79 
 
 
386 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646071  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.59 
 
 
396 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.0345333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.88 
 
 
386 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.32 
 
 
379 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.34 
 
 
381 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.97 
 
 
386 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  53.93 
 
 
388 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.92 
 
 
382 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  51.2 
 
 
395 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.44 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1387  butyryl-CoA dehydrogenase  48.7 
 
 
387 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  50.27 
 
 
394 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.66 
 
 
383 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
388 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428744 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6425  butyryl-CoA dehydrogenase  47.84 
 
 
380 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.8 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.52 
 
 
394 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.57 
 
 
382 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.82 
 
 
382 aa  338  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.83 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  45.93 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.93 
 
 
377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.93 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.93 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  44.5 
 
 
379 aa  335  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.14 
 
 
377 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.67 
 
 
379 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.86 
 
 
382 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.41 
 
 
377 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.14 
 
 
377 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.14 
 
 
377 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
379 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.88 
 
 
379 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 
379 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.83 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.36 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
379 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
379 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 
379 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 
379 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
379 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
379 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  44.62 
 
 
377 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.36 
 
 
377 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
376 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
376 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.14 
 
 
389 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.36 
 
 
380 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.18 
 
 
379 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  44.65 
 
 
379 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  44.65 
 
 
379 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  43.31 
 
 
379 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.09 
 
 
376 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  44.09 
 
 
376 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.57 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  43.83 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.09 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.36 
 
 
376 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.95 
 
 
375 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.53 
 
 
380 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 
381 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  44.62 
 
 
377 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  43.46 
 
 
379 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.62 
 
 
377 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>