More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0428 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0428  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 437 aa  906    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  46.82 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  46.52 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  46.95 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  44.34 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  44.34 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  46.35 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  44.12 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  45.03 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  44.79 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  45.41 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  44.02 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  44.92 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  45.29 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  44.82 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  45.39 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  42.76 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  44.72 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  44.47 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  44.47 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  42.89 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  43.54 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  44.3 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  44.65 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  43.32 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  44.12 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  42.79 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  42.22 
 
 		 446 aa  362  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  42.45 
 
 		 453 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  44.22 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  42.6 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  43.33 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  42.82 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  43.38 
 
 		 449 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  42.25 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  43.67 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  43.57 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  43.38 
 
 		 448 aa  353  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  42.7 
 
 		 446 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  43.51 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  41.56 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  40.84 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  43.05 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  40.89 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  41.36 
 
 		 453 aa  346  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  42.25 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  42.76 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  42.76 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  42.76 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  42.54 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  42.09 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  41.67 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  43.11 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  41.39 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  41.87 
 
 		 446 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  42.56 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  41.06 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  40.27 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  39.78 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  40.83 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  40.55 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  40.32 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  41.88 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  41.01 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  40.96 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  40.14 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  39.82 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  40.85 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  41.34 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  39.91 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  40 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  40.05 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  40.77 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  39.01 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  41.14 
 
 		 439 aa  315  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  40.59 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  38.9 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  39.36 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  41.04 
 
 		 451 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  41.23 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  39.5 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  40.09 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  39.59 
 
 		 444 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  39 
 
 		 442 aa  309  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  37.58 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  41.1 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  37.36 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  40.56 
 
 		 439 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  38.51 
 
 		 445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  40.81 
 
 		 444 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  39.86 
 
 		 449 aa  305  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  38.91 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  39.73 
 
 		 443 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  39.21 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  38.91 
 
 		 439 aa  302  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  38.62 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  37.95 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  37.07 
 
 		 440 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  38.16 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  37.73 
 
 		 448 aa  298  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>