More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0381 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  52.48 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  51.44 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  51.84 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.8 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0138  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.51 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.67 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.01 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.86 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.38 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0133  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  39.01 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  37.93 
 
 		 268 aa  222  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.81 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  38.61 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.86 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.76 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.2 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  38.38 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  38.38 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.72 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  36.49 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  37 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  37.07 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  37.5 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.65 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.65 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.84 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  37 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  35.57 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.79 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  38.1 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.35 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  35.91 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  34.72 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.35 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.45 
 
 		 277 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.55 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.69 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  36.39 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  35.84 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  34.72 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.49 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.33 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  34.72 
 
 		 283 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  36.33 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.11 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 276 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  34.72 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.89 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.67 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 		 275 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.01 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33 
 
 		 276 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.47 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.07 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.45 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.15 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  35.14 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  33.22 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  37.75 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  33.55 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  34.83 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.44 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  35.08 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  36.52 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.35 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.45 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  34.26 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.91 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.91 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.91 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.15 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.35 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.49 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.9 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  33.11 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  30.23 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  35.35 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.73 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  34.47 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  35.62 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.24 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.93 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.44 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.23 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.44 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.02 
 
 		 268 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  34.44 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.44 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>