23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4154 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1276    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.27 
 
 		 1344 aa  312  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  32.79 
 
 		 820 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  35.7 
 
 		 954 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  32.21 
 
 		 866 aa  277  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  34.2 
 
 		 832 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  39.96 
 
 		 867 aa  270  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  34.44 
 
 		 828 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  35.85 
 
 		 798 aa  261  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1123 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  31.54 
 
 		 845 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  29.62 
 
 		 777 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  29.62 
 
 		 798 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  29.62 
 
 		 798 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  30.64 
 
 		 812 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  31.87 
 
 		 797 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  30.65 
 
 		 728 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  29.46 
 
 		 782 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  29 
 
 		 750 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  27.5 
 
 		 747 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  27.65 
 
 		 726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  24.17 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1356 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>