23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2541 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1508    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  55.91 
 
 		 797 aa  775    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  38.09 
 
 		 747 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1123 aa  360  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  32.77 
 
 		 866 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  31.06 
 
 		 832 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  31.69 
 
 		 954 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  31.79 
 
 		 828 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  32.82 
 
 		 798 aa  306  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1344 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  29.2 
 
 		 820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  29.96 
 
 		 845 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  30.25 
 
 		 728 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  30.17 
 
 		 812 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  25.89 
 
 		 782 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  24.44 
 
 		 777 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  24.3 
 
 		 798 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  24.4 
 
 		 798 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  28.68 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  25.31 
 
 		 735 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  26.69 
 
 		 867 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  28.3 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1356 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>