23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2859 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  100 
 
 
866 aa  1768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  56.1 
 
 
954 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  55.59 
 
 
828 aa  854    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  55.18 
 
 
832 aa  869    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  44.79 
 
 
798 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  41.83 
 
 
812 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  40.7 
 
 
782 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  40.42 
 
 
820 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
1344 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  34.2 
 
 
798 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  34.31 
 
 
798 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  37.52 
 
 
777 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  33.94 
 
 
845 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  32.77 
 
 
750 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  30.65 
 
 
797 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  32.64 
 
 
1123 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  32.21 
 
 
728 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  30.81 
 
 
747 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  29.77 
 
 
726 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  33.28 
 
 
643 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  28.85 
 
 
735 aa  202  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  31.45 
 
 
867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  32.01 
 
 
1356 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>