24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1078 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1505    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1344 aa  217  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  28.9 
 
 		 820 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  28.85 
 
 		 866 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  29.3 
 
 		 798 aa  187  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  29.19 
 
 		 845 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  28.16 
 
 		 728 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  28.46 
 
 		 832 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  28.76 
 
 		 954 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  26.96 
 
 		 828 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1123 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  27.26 
 
 		 812 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  26.1 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  25.52 
 
 		 750 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  25.9 
 
 		 782 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  25.41 
 
 		 747 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  25.4 
 
 		 798 aa  111  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  25.15 
 
 		 777 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  25.15 
 
 		 798 aa  108  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  24.02 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  25.91 
 
 		 867 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1356 aa  62.4  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  33.82 
 
 		 726 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2229  hypothetical protein  25.69 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>