23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0328 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  100 
 
 		 726 aa  1451    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  36.12 
 
 		 798 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  32.39 
 
 		 954 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  31.36 
 
 		 866 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  31.98 
 
 		 828 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  31.16 
 
 		 832 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  30.5 
 
 		 812 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  29.83 
 
 		 782 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  28.82 
 
 		 820 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1344 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  27.02 
 
 		 845 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  24.43 
 
 		 777 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  24.71 
 
 		 798 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1123 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  24.53 
 
 		 798 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  27.65 
 
 		 747 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  25.49 
 
 		 797 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  27.16 
 
 		 643 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  28.37 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  27.85 
 
 		 728 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  27.48 
 
 		 867 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1356 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  33.82 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>