23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1169 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  100 
 
 
782 aa  1577    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  47.35 
 
 
812 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  40.7 
 
 
866 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  39.28 
 
 
832 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  40.14 
 
 
954 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  41.9 
 
 
828 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  35.18 
 
 
798 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  29.92 
 
 
820 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  28.55 
 
 
798 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.85 
 
 
1344 aa  318  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  28.55 
 
 
798 aa  318  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  28.42 
 
 
777 aa  317  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  29.56 
 
 
845 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  30.09 
 
 
747 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  29.02 
 
 
1123 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  27.27 
 
 
797 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  28.28 
 
 
728 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  25.89 
 
 
750 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  30.12 
 
 
726 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  29.65 
 
 
643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  25.79 
 
 
735 aa  130  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  29.3 
 
 
867 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  29.1 
 
 
1356 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>