23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1947 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1584    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  99.1 
 
 		 798 aa  1568    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  99.23 
 
 		 798 aa  1571    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  42.09 
 
 		 832 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  39.68 
 
 		 954 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  39.86 
 
 		 828 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  37.52 
 
 		 866 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  35.99 
 
 		 798 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  31.7 
 
 		 812 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  31.68 
 
 		 820 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  28.42 
 
 		 782 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1344 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1123 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  26 
 
 		 845 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  27.02 
 
 		 747 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  24.93 
 
 		 797 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  29.57 
 
 		 643 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  24.62 
 
 		 728 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  24.06 
 
 		 750 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  30.9 
 
 		 867 aa  169  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  23.66 
 
 		 726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1356 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  26.1 
 
 		 735 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>